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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  33 lines
  1. ***********************
  2. * C2 domain signature *
  3. ***********************
  4.  
  5. Some isozymes of protein kinase C (PKC) [1] contain  a domain, known as C2, of
  6. about 116 amino acid residues  which is located between the  two copies of the
  7. C1 domain (that bind phorbol esters and diacylglycerol) and the protein kinase
  8. catalytic domain. The function of the C2 domain is not yet clear, but it could
  9. be involved  in calcium-dependent  phospholipid binding.  The  isozymes of PKC
  10. that contain a C2 domain  are:  alpha, beta-I, beta-II, gamma,  and Drosophila
  11. PKC1 and PKC2.
  12.  
  13. The C2 domain is also found in synaptotagmin (p65) [2,3],  a synaptic  vesicle
  14. protein that binds acidic phospholipids and that may have a regulatory role in
  15. the membrane  interactions  during  trafficking  of synaptic  vesicles  at the
  16. active zone of the synapse. There  are  two copies of the C2 domain in p65 and
  17. they are located in the cytoplasmic C-terminal part of the protein.
  18.  
  19. The signature pattern  we developed for the C2 domain  is  located in the most
  20. conserved part of that domain (positions 34 to 49).
  21.  
  22. -Consensus pattern: [AG]-x(2)-L-x(3)-D-x(2)-G-x-S-D-P-Y
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: December 1992 / Text revised.
  26.  
  27. [ 1] Azzi A., Boscoboinik D., Hensey C.
  28.      Eur. J. Biochem. 208:547-557(1992).
  29. [ 2] Perin M.S., Fried V.A., Mignery G.A., Jahn R., Suedhof T.C.
  30.      Nature 345:260-263(1990).
  31. [ 3] Perin M.S., Johnston P.A., Oezcelik T., Jahn R., Francke U., Suedhof T.C.
  32.      J. Biol. Chem. 266:615-622(1991).
  33.